تیم ملی از زمانی که بوسنی و هرزگوین مستقل شده پنج بار با این تیم بازی کرده است. ایران چهار بار نماینده بالکان را شکست داده و فقط یک بار مقابل این تیم مساوی کرده است.
اولین رویارویی این دو تیم به سال 2001 بازمی گردد. آخرین بار هم دو تیم در سال 2009 در سارایوو با یکدیگر بازی کردند که در آن بازی تیم ایران موفق شد بازی دو بر صفر باخته را با نتیجه 3 بر 2 ببرد. دو گل بوسنی در آن دیدار را "ادین ژکو" به ثمر رساند.
فهرست بازیهای ایران مقابل بوسنی و هرزگوین:
22 ژوییه 2001: بوسنی و هرزگوین 2 - ایران 2
10 اوت 2001: ایران 4 - بوسنی و هرزگوین صفر
2 فوریه 2005 : ایران 2 - بوسنی و هرزگوین یک
31 مه 2006: ایران 5 - بوسنی و هرزگوین 2
12 اوت 2009: بوسنی و هرزگوین 2 - ایران 3