خاویر پاستوره از زمان انتقال به آاس رم طی دو فصل اخیر با 7 مصدومیت مختلف روبرو شده است. او فقط 32 بار با پیراهن رم در همه رقابت ها به میدان رفته و تقریبا نیمی از بازی های جالوروسی را به دلیل مصدومیت از دست داده است. آخرین مصدومیت خاویر پاستوره از ناحیه لگن است.
خاویر پاستوره در اواسط فصل 2019/20 با مصدومیت از ناحیه لگن روبرو شد و از آن زمان نتوانست به طور موثر برای رم به میدان برود. اکنون به نقل از وبسایت رم؛ خاویر پاستوره در اسپانیا تحت عمل جراحی لگن قرار گرفته است. این عمل موفقیت آمیز بوده اما با توجه به نادر بودن نوع این مصدومیت در فوتبال، روند ریکاوری و زمان بازگشت این هافبک 31 ساله به میادین مشخص نیست.