سیروس دین محمدی هم به همراه علی موسوی و داریوش یزدانی و مهدی پاشازاده و سرژیک تیموریان در سال ۷۸ به بوندسلیگا ترانسفر شد.(یک فصل در این تیم ماند)و پس از انجام چند بازی خوب از خودش توانست در ترکیب ثابت تیمش باشد و پس از انجام ۳۲ بازی به استقلال برگشت.