نکته:فقط مسابقات لیگ قهرمانان آسیا در فرمت جدید محاسبه شده‌است.
۱-فرهاد مجیدی(۱۳گل):سرمربی فعلی آبی ها که روزگاری بازار گلزنی اش در استقلال داغ بود،در صدر این فهرست قرار دارد.مجیدی از سال ۲۰۰۹ تا ۲۰۱۳(به جز ۲۰۱۲) برای استقلال در لیگ قهرمانان بازی کرد و با این تیم به نیمه‌نهایی مسابقات هم رسید.فرهاد مجیدی همچنین آقای گل بازیکنان ایرانی در تاریخ مسابقات آسیایی نیز هست.مجیدی مهاجمی تکنیکی و با ظرافت و با دقت شوتی بسیارخوب بود که تا سال ها او را نزد طرفداران استقلال محبوب نگه داشته‌است.
۲-آرش برهانی(۱۱گل):بازیکنی که زمانی ماشین گلزنی استقلال بود،فقط ۲گل با شاه فرهاد فاصله دارد.برهانی از مسابقات سال ۲۰۰۹ تا ۲۰۱۴ در استقلال حاضر بود.این مهاجم زهردار،در مسابقات پلی‌آف سال ۲۰۱۲ توانست ۲گل مقابل الاتفاق به ثمر برساند که اگر این ۲گل را حساب کنیم(که اینجا محاسبه نشده) به مجیدی میرسد و برترین گلزن استقلال در لیگ قهرمانان میشود.آرش مهاجمی فرصت طلب بود و میتوانیم بگوییم برای گلزنی به یک اشاره نیاز داشت.
۳-مامه تیام(۷گل):هنوز هم هستند استقلالی هایی که حسرت جدایی این مهاجم سنگالی گلزن را دارند.تیام در سال ۲۰۱۸ تا مرحله یک‌هشتم نهایی در استقلال حضور داشت و فقط ۸بازی نیاز داشت تا خود را ۷گله کند.البته مامه تیام تعدادی از بازی ها را به دلیل مصدومیت از دست داد و آمار فوق‌‌العاده هر بازی حداقل ۱گل را به جا گذاشت.تیام با این عملکرد،بهترین گلزن خارجی تاریخ استقلال در لیگ قهرمانان هم هست.
۴-کاوه رضایی(۶گل):کرمانشاهی چارچوب شناس بر رتبه چهارم این فهرست چیره شده!کاوه در فصل ۲۰۱۷ لیگ قهرمانان آسیا ۶گل برای آبی ها به ثمر رساند.همچنین به مانند مامه تیام در دور برگشت یک‌هشتم گلی زیبا را زد اما در مقابل ۶گل العین،کفایت نکرد.کاوه بعد از این فصل به لیگ بلژیک رفت و امروز،از خطرناک ترین مهاجمان فوتبال ایران است.
۵-شیخ دیاباته(۵گل):شیخ،بهترین گلزن استقلال در لیگ قهرمانان است که هنوز برای آبی ها توپ میزند.دیاباته بخش زیادی از گل های خود را در همین فصل ۲۰۲۱ به ثمر رسانده.شیخ دیاباته ۳گل نیز در مسابقات پلی‌آف فصل پیش زد که البته در این مقاله،شمرده نشده‌است.این مهاجم قدبلند،شاید به خاطر پاهای بلند و فیزیک بدنی‌اش گاهی نتوانسته چنگی به دل بزند اما مطمئنا هنوز هم از مهاجمین خطرناک استقلال و حتی آسیا به شمار می‌آید.
۶-محمد قاضی(۴گل):یکی از مارکوپلو های فوتبال ایران جایگاه ششم را از آن خود کرده‌است.قاضی در سال ۱۳۹۲ به استقلال پیوست و ابتدا ۴بازی از مسابقات باقی‌مانده سال ۲۰۱۳ و سپس همه بازی های استقلال در فصل ۲۰۱۴ را در استقلال حضور داشت.محمد قاضی روزگاری از محبویت خوبی نزد طرفداران استقلال برخوردار بود.
۷-مهدی قایدی(۴گل):مهاجم ریزنقش،تکنیکی و جوان بوشهری با ۴گل زده در رتبه هشتم قرار گرفته و مطمئنا توان اضافه کردن به این گل ها را هم دارد.بازیکنی از سوی رسانه ها نیمار آسیا لقب گرفته،یک دوره یعنی ۲۰۱۸ را به دلیل مصدومیت از دست داد و از دور یک چهارم نهایی به بازی ها رسید.قایدی به دلیل تعداد بازی بیشتر نسبت به قاضی این جایگاه را دارد.حرکات مارادونایی او و گل های بعضا زیبایی که به ثمر میرساند،از او یک فوتبالیست آینده دار ساخته که احتمالا تیم های عربی به دنبال شکار این الماس هستند.
۸-جی‌لوید ساموئل(۴گل):گلی که توسط باد سرنوشت،پرپر شد نیز ۴گل برای استقلال به ثمر رسانده‌است.ساموئل از سال ۲۰۱۲ تا ۲۰۱۴ در این مسابقات برای استقلال توپ میزد.تعداد گل های جی‌لوید به نسبت پستش که معمولا دفاع چپ بود و گاهی هافبک چپ یا هافبک دفاعی هم بازی میکرد،خوب است.جی‌لوید فقید همچنین علاوه بر گلزنی،امکان گل زدن هم‌تیمی هایش را نیز فراهم میکرد و بی شک این بازیکن ترینداد و توباگویی،از بهترین دفاع چپ های تاریخ استقلال است.ساموئل به خاطر بازی بیشتر نسبت به قایدی این مکان را تصاحب میکند.
۹-فرشید اسماعیلی(۴گل):هافبک خلاق و بازیساز استقلال هم با ۴گل رتبه نهم را دارد.فرشید اسماعیلی بی شک از بهترین یارهای استقلال در چند فصل اخیر لیگ قهرمانان است و پاس گل های زیادی را نیز داده.او در همین دوره موفق شده هم گلزنی کند،هم پاس گل بدهد و هم پنالتی بگیرد.فرشید از فصل ۲۰۱۷ برای استقلال در لیگ قهرمانان بازی میکند و از تجربه فراوانی برخوردار است.شاید بتوان گفت که فرشید اسماعیلی،سبک بازی نزدیک به مجتبی جباری دارد!
۱۰-علی سامره(۳گل):شاید این رفسنجانی گلزن و چارچوب‌شناس گل های کمی زده باشد اما نباید فراموش کرد که علی سامره ۳گل را در تنها ۳بازی به ثمر رسانده!در فصل ۲۰۰۲-۰۳ سامره در ۳بازی دور گروهی که استقلال حذف شد،۳توپ را به تور دروازه رقبا هدایت کرد.سامره به خاطر همین میانگین خوب،بالاتر از نفراتی چون نکونام و منتظری،رتبه دهم را گرفته‌است.
.
سایرین:علاوه بر نفرات فوق،جواد نکونام،پژمان منتظری،سیدمهدی سیدصالحی،علی کریمی و ارسلان مطهری ۳گل برای استقلال در این مسابقات زده‌اند.رسول خطیبی،بوبکر کبه،علی علیزاده،خسرو حیدری،حنیف عمران‌زاده،هوار ملامحمد،گوران یرکوویچ،علی قربانی،مرتضی تبریزی،وریا غفوری،حسین کاظمی و محمد نادری نیز ۲بار توپ را با دروازه رقبا آشنا کردند.آندو،بیگ‌زاده،امید ابراهیمی،جباری،جابر انصاری،محسن کریمی،پادووانی،جپاروف،زندی،سیاوش اکبرپور،دانشگر،چشمی،امیرحسین صادقی،روح‌الله باقری و فرشید باقری هم هر کدام ۱بار آدرس دروازه حریف را به توپ داده‌اند و موفق به گلزنی شده‌اند.۳گل از گل های استقلال نیز گل به خودی رقبا بوده‌است.
