تا سال ۱۹۹۰میلادی هر تیمی در کشور خودش قهرمان لیگ میشد به جام باشگاه های آسیا میرفت جامی که تا الان ادامه داردا؛ در سال ۱۹۹۱ کنفدراسیون فوتبال آسیا تصمیم گرفت یک جام بین قهرمانان جام حذفی هر کشور برگزار کند و به این ترتیب در سال ۱۹۹۱ جام در جام آسیا تاسیس شد و پرسپولیس ایران در اولین دوره جام در جام آسیا قهرمان شد ؛ سه تیم پرافتخار جام در جام آسیا : الهلال عربستان : ۲ قهرمانی و یوکوهاما : ۲ قهرمانی و پرسپولیس ایران : ۱ قهرمانی ؛
پرسپولیس و استقلال ایران هر دو تیم ۳ بار در جام در جام آسیا شرکت کردند : عملکرد پرسپولیس : ۲ فینال و ۱ قهرمانی و ۱ نایب قهرمانی و عملکرد استقلال : ۲ مقام چهارمی یعنی استقلال هرگز به فینال جام در جام آسیا نرسید در حالی که پرسپولیس قهرمان جام در جام آسیا شده ؛ پرسپولیس در جام باشگاه های آسیا قهرمان نشده ولی ۲ بار به فینال رفته و استقلال هم قهرمان جام در جام آسیا نشده ولی به فینال جام در جام آسیا هم نرسیده و اینکه در سال های دور کنفدراسیون فوتبال آسیا دو جام مختلف برگزار میکرد یکی برای قهرمانان لیگ هر کشور ( جام باشگاه های آسیا ) و یکی برای قهرمانان جام حذفی هر کشور ( جام در جام آسیا) و هیچ کدام از این جام ها از یکدیگر بالاتر یا پایین تر نیستند و پرسپولیس سومین تیم پرافتخار جام در جام آسیا عاست ؛ استقلالی ها می گویند جام در جام آسیا سطح پایین بود و به همین دلیل پرسپولیس قهرمان شد در حالی که استقلال در جام در جام آسیا سه بار شرکت و ۲ بار به رده بندی رفت و حتی رده بندی را نیز باخت و چهارم شد و حتی سوم هم نشد تا شاید یک تکه آهن به عنوان مدال برنز بگیرد ؛ آنهایی که میگویند پرسپولیس در سطح آسیا قهرمانی ندارد بچه هایی هستند دهه هشتادی که مادرشان تازه به آنها گوشی داده و خود AFC نیز پرسپولیس را تنها تیم ایرانی جام در جام آسیا معرفی کرد که قهرمان شد و با کمترین جستجو در اینترنت قابل مشاهده است و جام در جام آسیا سال 2002 منحل و سهمیه آن به جام باشگاه های آسیا داده شد