بهترین روزهای تاریخ نفت تهران در دهه نود بود و آنها در سالهای میانی دهه نود با کسب عنوان سوم لیگ و قهرمانی در جام حذفی یکی از بهترین تیم های فوتبال کشور بودند.
به گزارش طرفداری، بهترین های تاریخ باشگاه نفت تهران عبارت هستند از:
دروازه بان ها: منصور رشیدی، علیرضا بیرانوند، سوشا مکانی
مدافعان: احمد آل نعمه، حمید فرزام نیا، محسن بنگر، هاشم بیگ زاده، مهدی شیری، سیدجلال حسینی، مرتضی پورعلی گنجی، وریا غفوری، میثم حسینی، محمد دانشگر، میلاد فخر الدینی، بهرام میرشیبانی، عبدالعلی کلانتری
خط میانی: وحید امیری، محمد مایلی کهن، آرش رضاوند، امید عالیشاه، محسن یوسفی، علیرضا عزت کرامت، کمال کامیابی نیا، محسن یوسفی، ایمان مبعلی
مهاجمان: عیسی آل کثیر، حمید مجد تیموری، غلامرضا رضایی، مجید سلیم پور، سجاد شهباززاده، پیام صادقیان، محمد قاضی، ارسلان مطهری، رضا نوروزی، هادی نوروزی، ارسلان مطهری
بهترین بهترین ها:
- علیرضا بیرانوند، سیدجلال حسینی، مرتضی پورعلی گنجی، وریا غفوری، حمید فرزام نیا، محمد مایلی کهن، وحید امیری، ایمان مبعلی، کمال کامیابی نیا، پیام صادقیان، حمیدمجد تیموری
سرمربی: عارف سیدعلیخانی، علیرضا منصوریان
تیم نفت تهران در دهه شصت سیر پرتداومی داشت اما بازیکنان متوسط بسیاری در تیم نفت تهران مقطع مورد اشاره حضور داشته اند که البته بالاترین رتبه آنها در فوتبال تهران در دهه شصت، رتبه هشتم در مسابقات فوتبال سال 1361 تهران بود.