علی رغم سلامت قاطبه اساتید، اعضای هیات علمی و کارکنان دانشگاه آزاد اما برخی از مدیران سابق این مجموعه اقدام به تصرفات غیر قانونی و حیف و میل اموال دانشگاه می‌کردند. مفاسد اقتصادی در مدیریت قبلی دانشگاه آزاد بسیار زیاد بود و بهره برداری های غیرقانونی از این مجموعه عظیم صورت می‌گرفت. برخی از مدیران سابق این مجموعه بزرگ اقدام به تصرفات غیر قانونی و حیف و میل اموال حاصل از شهریه های دانشجویان نمودند که اکثریت این دانشجویان را خانواده های کم بضاعت تشکیل می‌دهند. برخی مدیران وقت دانشگاه آزاد علی رغم اطلاع از این مشکلات مالی با چشم پوشی و تسامح نسبت به آنها سکوت می کردند. هر کسی از این مفسده ها مطلع می‌شد برای سهیم شدن در سوء استفاده‌ها اگر سکوت می‌کرد، حق السکوت هم می‌گرفت. برخی هم به علت ترس از دست دادن موقعیت شغلی خود هیچگاه حاضر نشدند نسبت به مفاسدی که از آن اطلاع داشتند سخنی بگویند. چند خانواده اصلی به ترتیب میزان نفوذ زمام مدیریتی این دانشگاه را در اختیار داشتند و این ثروت عظیم که متعلق به همه ملت ایران است را غنیمت خود می دانستند. سوء استفاده از ظرفیت های شهریه دانشجویان، نقل و انتقالات، ساخت و ساز و ... در دانشگاه آزاد اسلامی از جمله بسترهایی بود که مورد سوء استفاده مشخصا یک خانواده که در راس بود و بعضی از خانواده ها در مراتب بعدی قرار می‌گرفت. هر کسی از این مفسده ها مطلع می‌شد برای سهیم شدن در سوء استفاده‌ها اگر سکوت می‌کرد، حق السکوت هم می‌گرفت. برخی هم به علت ترس از دست دادن موقعیت شغلی خود هیچگاه حاضر نشدند نسبت به مفاسدی که از آن اطلاع داشتند سخنی بگویند. ر پایان باید متذکر شد این گوشه‌ای از مسائل مالی مشکلات و مفسده‌هایی است که مدیران جدید دانشگاه با آن روبرو هستند اگر مسائل دیگری نظیر سوء استفاده های (الف- م) را در مناقصات، قراردادها، پست فروشی ها و خاصه خرجی‌ها را بخواهند برای افکار عمومی بازگو کنند مثنوی 100 من کاغذ می‌شود. ***نکته: این حقوق ها جدای از مزایای موسمی و انواع پاداش و هزینه سفر به خارج از کشور تنظیم شده است.