پس از کش و قوس‌های فراوان و شایعات ریز و درشت امیر قلعه‌نویی به عنوان سرمربی تیم ملی ایران انتخاب شد.قلعه‌نویی برخلاف دوره اول حضور روی نیمکت ایران این بار عنوان پرافتخارترین مربی ایران را یدک میکشد.علیرغم همه جامها و افتخارات داخلی،عملکرد آسیایی قلعه‌نویی همواره مورد انتقاد بوده‌است.شاید بخشی از این انتقادات آنهم در شرایطی که سالهاست تیم‌های ایرانی در آسیا عملکرد خوبی ندارند به‌حق نباشد اما آنچه مشخص است عملکرد آسیایی قلعه‌نویی نسبت عملکرد داخلی‌اش بسیار ضعیف‌تر است.        امیر قلعه‌نویی جمعا هشت بار همراه چهار تیم مختلف ایرانی در لیگ‌قهرمانان حضور داشته و از این نظر رکورد دار است البته در آخرین حضور فقط برای دوبازی دور گروهی روی نیمکت سپاهان نشست و پس از آن از هدایت زردپوشان کنار گذاشته شد.دوبازی که با یک برد چهارگله و یک شکست سه‌گله همراه بود.         در هفت حضور دیگر امیر قلعه‌نویی چهار بار موفق به صعود از دور گروهی شده است تا هر یک از تیم های تحت هدایت خود را حداقل یک بار به مرحله حذفی رسانده باشد.تراکتور که تا قبل از قلعه‌نویی سه بار در این مسابقات چهارم گروه خود شده بود اولین صعود خود را همراه این مربی به عنوان صدرنشین تجربه کرد.        سه صعود از این چهار صعود به عنوان تیم صدرنشین بوده‌است و از قضا هر سه بار بالاتر از پرافتخارترین تیم آسیا یعنی الهلال صدرنشین گروه خود شده‌است.        حاصل چهار حضور قلعه‌نویی در مرحله یک‌هشتم نهایی دوبار حذف شدن با ذوب‌آهن و تراکتور و دوبار صعود همراه سپاهان و استقلال بوده است.قلعه‌نویی پس از رساندن سپاهان به یک‌چهارم از این تیم جدا‌شد اما در تنها حضور خود در این مرحله با استقلال،موفق شد خود و استقلال را به نیمه‌نهایی برساند‌.حضور در نیمه‌نهایی چندان برای قلعه‌نویی خوش یمن نبود و تیم قلعه‌نویی برابر اف‌سی سئول کره شکست خورد و از دور مسابقات کنار رفت.این حضور در نیمه نهایی بهترین عملکرد استقلال در فرمت جدید لیگ‌قهرمانان و بهترین عملکرد خود قلعه‌نویی در این مسابقات است. عملکرد تیم‌های تحت هدایت قلعه‌نویی در لیگ‌قهرمانان آسیا: ۵۴ بازی ۲۴ برد(۴۴ درصد پیروزی) ۱۸ باخت(۳۳ درصد شکست) ۱۲ مساوی ۸۱ گل زده ۶۰ گل خورده