در طول تاریخ اهدای توپ طلا، چندین مورد وجود داشته است که انتخاب برنده بحث‌برانگیز بوده است. اغلب، این به دلیل این است که در آن سال بازیکنان دیگری وجود داشتند که بسیاری معتقد بودند عملکرد بهتری داشته‌اند یا دستاوردهای تیمی مهم‌تری کسب کرده‌اند.

برخی از نام‌هایی که معمولاً در بحث‌های مربوط به برندگان بحث‌برانگیز توپ طلا مطرح می‌شوند عبارتند از:

شایان ذکر است که برنده توپ طلا بر اساس رای روزنامه‌نگاران از سراسر جهان انتخاب می‌شود و معیارهای رای‌گیری در طول سال‌ها تغییر کرده است. این می‌تواند منجر به نتایجی شود که برای برخی بحث‌برانگیز به نظر می‌رسد.