هنوز لیگ سراسری در کشور شکل نگرفته بود که سومین دوره مسابقات جام باشگاههای آسیا از راه رسید و ایران برای دومین بار نماینده ی خود را به مسابقات فرستاد ( در دومین دوره مسابقات، پرسپولیس به عنوان نماینده ایران شرکت کرد و حائز رتبه چهارم شد ) و این بار آبی های پایتخت شانس حضور در رقابتهای آسیایی را داشتند .
آبی ها در مرحله گروهی با دو نتیجه سه بر صفر از سد هومنتمن لبنان و سلانگور مالزی گذشتند . در نیمه نهایی با دو گل مدان اندونزی را از پیش رو برداشتند و در فینال نیز با گلهای غلام وفاخواه و مسعود معینی با نتیجه دو بر یک هاپوئل اسرائیل قهرمان دوره نخست مسابقات را شکست دادند و با اقتدار به اولین قهرمانی آسیایی خود رسیدند .

پس از قهرمانی در جام باشگاههای آسیا در تاریخ 21 فروردین 1349 و در مرداد همان سال اولین دوره لیگ سراسری ایران با نام جام منطقه ای آغاز به کار کرد . این مسابقات در سه مرحله مقدماتی ، گروهی و پایانی برگزار می شد . استقلال ( تاج ) مرحله مقدماتی را با کسب سه برد در سه مسابقه به پایان برد و به عنوان تیم نخست منطقه ب راهی مرحله گروهی شد . آبی پوشان در این مرحله با کسب یک برد و دو تساوی و به لطف تفاضل گل بهتر نسبت به تاج آبادان باز هم به عنوان صدر نشین راهی مرحله پایانی شد . در مرحله پایانی و در بازی نیمه نهایی آبی ها در تقابل با رقیب تاریخی خود یعنی پرسپولیس قرار گرفتند . در حالیکه این بازی با نتیجه۱–۱ تا دقیقه ۸۰ جریان داشت ، به علت ترک زمین بازی توسط بازیکنان پرسپولیس نتیجه ، سه بر صفر به سود تاج اعلام شد و به این ترتیب آبی های پایتخت به فینال مسابقات راه یافتند . در فینال نیز تاج به لطف گل های غلامحسین مظلومی و اکبر کارگر جم پاس تهران را با نتیجه دو بر یک شکست داد و در زمستان 1349 علاوه بر قهرمانی در اولین دوره رقابتهای لیگ سراسری موفق به ثبت اولین دبل تاریخ باشگاههای ایرانی شد . عملکرد استقلال(تاج) در سال 1349 را می توان بهترین عملکرد تاریخ تیم های ایرانی در طول یک سال شمسی دانست .
ستارگان تیم : ناصر حجازی ، علی جباری ، منصور پورحیدری ، غلامحسین مظلومی ، اکبر کارگر جم ، پرویز قلیچ خانی ، مسعود مژدهی
سرمربی : زدراکو رایکوف

نکات آماری :
- در این سال ، تاج اولین باشگاه ایرانی فاتح جام باشگاههای آسیا لقب گرفت
- در این سال ، استقلال ( تاج ) به عنوان اولین فاتح لیگ سراسری ایران شناخته شد .
- علی جباری به اولین کاپیتان فاتح جام باشگاه های آسیا بدل شد .
- علی جباری اولین کاپیتانی لقب گرفت که جام قهرمانی لیگ سراسری ایران را بالای سر برد .
- استقلال (تاج) اولین تیم ایرانی شد که در یک سال شمسی فاتح دو جام رسمی می شود ( بعدها سایپا در سال 1372 و پرسپولیس در سال 1378 موفق به کسب دو جام در یک سال شدند ) .
- استقلال (تاج) تنها تیم تاریخ تاریخ ایران شد که موفق به ثبت دبل لیگ – آسیا شد ( ساپیا و پرسپولیس موفق به ثبت دبل لیگ – جام حذفی شدند ) .
- استقلال (تاج) تنها تیمی نام گرفت که بدون شکست موفق به ثبت دبل شد . ( سایپا و پرسپولیس در لیگ شکست را تجربه کردند )
- استقلال به تنها تیم ایرانی بدل شد که بدون شکست قهرمان جام باشگاههای آسیا می شود . ( در بین دیگر تیم های ایرانی ، تنها پاس سابقه قهرمانی دارد که در راه قهرمانی آسیا متحمل شکست شده است . )
جدول عملکرد تیم استقلال (تاج) در سال 1349 شمسی
نام تورنمنت | بازی | برد | مساوی | باخت | گل زده | گل خورده | نرخ امتیازی |
باشگاههای آسیا | 4 | 4 | 0 | 0 | 10 | 1 | 3 |
لیگ | 8 | 6 | 2 | 0 | 18 | 4 | 2.5 |
مجموع | 12 | 10 | 2 | 0 | 28 | 5 | 2.67 |



